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Atelier Mathématiques et biologie 2004–2005

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Les similarités dans les structures protéiques vues sous un autre angle
Joël Pothier (univ. Paris VI)

17 janvier 2005

Finding pairwise or multiple similarities in protein structures is usually achieved by searching the best superposition of atoms or secondary structures, whether from a global or local point of view. Our opinion is that local strong similarities, even short ones, reflect better real similarities than global superposition. Furthermore, global superposition may miss effective local similarities that are not exactly in the same position when the two related structures are superposed.

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Joël Pothier Joël Pothier (univ. Paris VI)
Atelier de BioInformatique, Université Paris VI