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Atelier Mathématiques et biologie 2005–2006

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Statistique de motifs : et après ?
Stéphane Robin (INA-PG)

12 juin 2006

Les statistiques de motifs constituent aujourd’hui un outil standard de l’analyse des séquences biologiques. De nombreux résultats existent sur la probabilité d’occurrences, la loi du nombre d’occurrences, leurs positions, leurs répartitions dans différents modèles essentiellement markoviens.
Nous présenterons ici quelques développements récents et différents problèmes ouverts concernant notamment
- Quelques compléments des résultats présentés dans le livre ’ADN, mots et modèles’ (S. Robin, F. Rodolphe et S. Schbath)
- L’étude de motifs de structure particulière (motifs flous, motifs structurés) - Des méthodes effectives d’implémentation des calculs (’Finite Embedded Markov Chains’, automates)
- La recherche de motifs de régulation ou d’interaction.

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Stéphane Robin Stéphane Robin (INA-PG)
professeur de statistique
département organisation et modélisation de l’information et des processus
UMR 518 Mathématiques et Informatique Appliquées